经过好氧、厌氧细菌发酵腐熟出来的堆肥或沤肥即被称为有机肥，而品种繁多的生物有机肥‍是将芽孢杆菌接种在有机肥中，或者将真菌孢子拌入其中，这样即可产出芽孢杆菌类或木霉真菌类生物有机肥。同时，需要选出适合于不同功能卫生区的有机种类。然后检测出生物有机肥中微生物含量是否达到行业标准。那么生物有机肥和其他肥料的区别之处在哪呢？

1.登记地不同

生物有机肥料是指含有明确功能微生物菌种的一种特殊肥料，产品中含有特定数量的功能性细菌，还含有腐熟等有机肥料。属于微生物肥料与有机肥的统一结合体。在农业部等级，属于微生物肥料领域。其受民众喜爱的原因主要包括抗土传病害、促进根系生长以及提高肥料利用率。

2.有机质不同

要发挥特定功能微生物的作用，必须要有特定的微生物和较高含量的有机质。鉴于上述作物生产和广大农民的需求，我们提出了一个“全元生物有机肥”的概念，其大概念是指能够改善土壤条件和促进植物生长的有机、无机、生物三大主成分，小概念是指能够提供植物生长所必需的各种营养元素和部分氨基酸。价格公道的生物有机肥必须具备增产当季节农作物产量，培肥土壤以及降低农业肥料等作用，因此也必将成为今后肥料行业中的主打产品。

需要明确的是，菌种包括菌剂、生物肥料、生物菌剂等，堆肥和有机肥包括精致有机肥、商品有机肥等都不是生物有机肥。生物有机肥的功效应该比高效菌种（菌剂）与有机营养载体的联合施用时更大，这也是主要的区别。区分出两者之间的区别，这应该也是研发中比较重要的一步，对于肥料的研究筛选，要带着比较明晰的目标去进行研究。